陰道上皮萎縮
年老婦女雌激素缺乏所致的上皮萎縮陰道細胞學檢查可能被懷疑為癌；組織學檢查因整個上皮可由基底細胞或亞基底細胞構成和上皮頂層細胞缺乏糖原碘試驗陽性而與陰道上皮內腫瘤相似但此類病人可在陰道內使用雌激素軟膏持續周后再行陰道細胞學或組織學檢查可恢復為正常的陰道上皮

陰道的子宮內膜異位
罕見常好發于穹窿部其結節隨月經次數增加而增大周圍呈炎癥性浸潤狀往往合并盆腔常有痛經或性交痛陰道子宮內膜異位發生癌變時在組織上必須看到正常的子宮內膜和子宮內膜腺癌之間的過渡形態

陰道尖銳濕疣
肉眼觀察此類病灶難以與陰道鱗狀上皮癌鑒別均需依靠組織學檢查

癥
陰道炎與早期陰道癌有時在肉眼上難以分辨尤其是癌灶為多中心或彌漫性生長時需借助組織學檢查

前庭大腺
發生在接近陰道口側壁的陰道平滑肌肉瘤與前庭大腺實性惡性腫瘤有時難以區別可依據病理組織學檢查作鑒別

子宮內膜腺癌陰道轉移
部位多在陰道下段左右兩側或尿道下方孤立結節位于粘膜或粘膜下腫瘤結節可破潰形成潰瘍出血和感染可伴有子宮增大子宮腔診刮陽性

尿道旁腺癌
多累及陰道前庭可有尿頻尿痛或排尿障礙

前庭大腺腺癌
多累及陰道下段側壁腫塊位置較為深

惡性滋養細胞腫瘤的陰道轉移
往往于粘膜下呈紫藍色結節潰破時可導致大出血有流產正常產或葡萄胎歷史子宮通常增大或有卵巢黃素囊腫尿妊娠試驗陽性或血β-HCG異常升高