巧克力囊腫讓女性陷入痛苦的深淵，巧克力囊腫除了讓女性在每個經期痛苦萬分之外，引起的最大麻煩就是不孕。因為它會傷害到體內的組織，如果在腸胃附近，就會造成腹瀉腸胃疼痛；如果是在卵巢，就會影響到卵巢、輸卵管功能，造成不孕。嚴重的巧克力囊腫甚至從根本上顛覆女性做母親的天職。
　　
　　得了巧克力囊腫就一定會不孕嗎？專家表示：卵巢巧克力囊腫引發不孕患者不孕率達到40%之高，女性得了巧克力囊腫，有痛經、性交痛、經血改變和不育等麻煩。通常在月經初潮后的幾年內，月經是正常的，數年以后則出現逐漸加劇的痛經。當巧克力囊腫破裂時，可有劇烈的刀割樣下腹痛，甚至昏厥；其次是性交疼痛，主要發生在陰莖頂入陰道深處時，有時甚至因劇痛而不敢性交。
　　
　　至于經血改變，可有月經增多、經期延長或經前點滴出血。患病后雖然卵巢能照樣排卵，但因為輸卵管受變化了的血液刺激，與周圍有粘連，妨礙了輸卵管的活動，使輸卵管不能象手指那樣靈巧地把卵巢排出的卵子撿拾到輸卵管中去，當然也就不容易懷孕了。

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